Integrated Genome Browser

Ícone transparente PNG do navegador do genoma integrado

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Versão 9
Plataforma Ícone do Windows PNG Transparente Ícone do Mac PNG Transparente Ícone do Linux PNG Transparente
Licença Código Aberto 
Categoria Científico
Mais Informações  

Visão geral do software

Principais características

Suporta vários formatos de genoma, como GenBank e FASTA
Interaja com os dados com animações de zoom e panorâmica
Acesse e carregue genomas de sites QuickLoad
Transforme os dados em várias formas de gráfico
Compartilhe dados com colaboradores por meio do Dropbox
Instale plugins para funcionalidades adicionais

Integrated Genome Browser (IGB) é um programa de código aberto usado para visualizar e explorar grandes conjuntos de dados genômicos.

Você pode visualizar vários formatos de dados, interagir com seus dados, criar gráficos, salvar suas informações como imagens, e compartilhe seus dados com colaboradores.

O IGB permite que você visualize dados de anotações e sequências alinhadas.

O programa suporta uma variedade de formatos, como FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband, e GenBank.

Você pode pegar dados e transformá-los em uma variedade de formas de gráficos, incluindo gráficos de incompatibilidade para destacar diferenças de dados e gráficos de profundidade para mostrar cobertura.

Você também pode interagir com seus dados por meio Animações de zoom e panorâmica do IGB.

O IGB permite que você acesse e carregue genomas de sites QuickLoad, que são sistemas simples de diretórios, sequências e outros arquivos de dados para fins de visualização.

O IGB fornece funcionalidade avançada com suporte a plug-ins para adicionar funcionalidade e automação do fluxo de trabalho por meio do uso de scripts.

O IGB também oferece recursos avançados para compartilhar seus dados, seja publicando-os como JPEG de alta qualidade, PNG ou imagem SVG ou armazenamento de dados no Dropbox para dar aos seus colaboradores acesso ao seu projeto.

IGB é usado principalmente por pesquisadores universitários, biólogos e bioinformáticos.

Ele fornece ferramentas avançadas para abrir um variedade de formatos de dados do genoma, visualizando dados como gráficos diferentes e compartilhando dados com colaboradores.

Infelizmente, o programa depende de concessões para desenvolvimento contínuo, o que significa que o suporte para o aplicativo pode cessar a qualquer momento.

No entanto, Integrated Genome Browser ainda é um programa capaz e personalizável para usuários que procuram explorar e analisar seus dados de genoma.

Tipos de arquivos suportados

Nesta seção, você pode conferir quais são os tipos de arquivos suportados ou compatíveis com o Integrated Genome Browser.

Extensão de arquivo principal

.XML - Arquivo XML

Outras extensões de arquivo usadas pelo Integrated Genome Browser 9

Extensões Compatíveis
.BED Arquivo de faixa de anotação de cama UCSC
.DAS Sessão de Análise DeltaMaster
.FA Arquivo de sequência formatado FASTA
.FAS Arquivo de sequência FASTA
.FASTA Arquivo de sequência FASTA
.GB Arquivo de dados do GenBank
.SGR Arquivo de dados do genoma do SGR
.USEQ Arquivo de dados do genoma USeq

Sobre as informações do Integrated Genome Browser

Nosso objetivo é ajudar você a ter uma visão geral do Integrated Genome Browser, entender suas principais características e quais arquivos/extensões são compatíveis com ele.

A descrição do Integrated Genome Browser, a extensão primária e as extensões compatíveis listadas nesta página foram pesquisadas ​​e verificadas individualmente pela equipe do Ficheiros.

Nós nos esforçamos para que as informações estejam 100% precisas e publicamos apenas informações sobre os programas que testamos e validamos.

Extensões populares
1 PHP
Arquivo de código fonte PHP
2 EXE
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3 PDF
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4 APK
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