.CRAM Extensão de Arquivo

Arquivo de alinhamento comprimido

Desenvolvedor	EBI
Categoria	Dados
Formato	Binário

O que é um arquivo .CRAM? (Arquivo de alinhamento comprimido)

Formato de arquivo de alinhamento comprimido desenvolvido pela EBI, uma outstation do European Molecular Biology Laboratory; armazena alinhamentos de leitura de sequência de DNA curtos gerados a partir de alinhadores de leitura curta, como BWA, BBMap e BLAT.

Mais Informações

O formato de arquivo CRAM é semelhante ao formato de arquivo BAM (Binary Alignment/Map), mas apresenta melhor compressão de arquivos e um formato de contêiner binário orientado para colunas reestruturada. À medida que os volumes de dados aumentam no campo do software genético, o formato CRAM foi projetado para reduzir a impressão do pé do disco dos dados de alinhamento.

O alinhamento de leitura curta é o processo de decifração de onde vem uma sequência no genoma. Isso pode ser difícil, já que o genoma de referência é bastante grande e você nem sempre está procurando por correspondências exatas no genoma de referência. Alinhadores de leitura curta são usados para pesquisar sequências enormes para partidas e quase-partidas. Como as sequências são tão grandes, a compressão fornecida por formatos como CRAM é necessária para manter os tamanhos dos arquivos gerenciáveis.

Programas que abrem o arquivo .CRAM (Arquivo de alinhamento comprimido)

Windows
Samtools